Članom 15. Zakona o VSTV-u, Vijeću je omogućeno da provodi, odnosno upravlja, finansijski i administrativno, sredstvima posebnih projekata reforme pravosuđa finansiranih iz donacija međunarodne zajednice. Sredstva za ove projekte vode se na posebnim računima otvorenim kod Centralne banke BiH i potpuno odvojenim od redovnog i operativnog budžeta VSTV-a. Sve finansijske transakcije odvijaju se putem Trezora BiH. Projektna sredstva mogu se koristiti samo za namjene precizno utvrđene odobrenim budžetom za projekt, odnosno za svrhu i na način definiran ugovorom između donatora i Visokog sudskog i tužilačkog vijeća. Na ovaj način implementiraju se sredstva projekata koje finansiraju:
- Evropska komisije (CARDS 2003, CARDS 2004, CARDS 2005),
- Vlada SAD-a,
- Norveška vlada,
- Italijanska vlada i
- Holandska vlade.